Честно - хз. Но я знаю, что FLA как-то конфликтует с modloader'ом. Как я понимаю, это связано с тем, что modloader подгружает свою среду, которая мешает работе FLA. Иногда это может привести к крашу игры. У меня такое было такое при добавлении файлов коллизии